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三代测序共存，就是各个技术之间不是完全替代关系，而是共存关系。 衡量测序技术，主要在于准确性，通量，读长，测序速度，价格等几个指标，简称为“多快好省”。下面总结一下当前各个平台技术特点： 一代测序：准确性高，读长长，通量低，价格高，速度慢； 二代测序：准确性高，读长短，通量高，价格低，速度慢； 三代测序：准确性低，读长长，通量高，价格高，速度快； 所以目前还没有一项测序技术可以完全取代其他的，就会造成一二三代并存的局面。需要根据使用目的，预算多少选择合适的平台。 所以，这个阶段还是需要学习二代测序： 1、二代测序目前依然是主流，每年产出数据量依然占90%以上； 2、很多分析与测序平台无关，例如得到基因组之后，后续的分析都是一致的； 3、“计数”类分析，二代测序更有优势，例如微生物检测，NIPT检测，差异表达计算等，二代测序更划算； 4、三代测序识别出来的SV，可以作为模板，依然可以用二代测序检测。
