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用Graphpad Prism绘制基因结构示意图

既然使用Graphpad Prism绘制,那么就要准确分区核苷酸序列,顺路还可以学习Graphpad Prism的一些小技巧,其绘制结果如下图所示。

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1、打开软件,新建一个Grouped(行列分组表)或者Contingency(列联表);

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2、按照下图输入某基因结构分区数据,各数据表示核苷酸坐标;

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3、选择Summary data下的水平Stacked bars(堆积柱状图);

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4、双击绘图区或者单击工具栏Format Graph图标,进入Format Graph,在Appearance选项卡中,选择Global-Change all data sets,然后取消勾选Show legend,把所有图例隐藏;

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  • 在Data Sets on Graph选项卡中,选中B~F列数据,将其和A列数据的关系都改为Superimposed(叠印),绘制叠印柱状图。此时,图中各矩形所占空间变短,自动生成的坐标轴范围不再适用,后面需要调整X轴范围。

  • 注意:Graphpad Prism中不能直接绘制叠印柱状图,需要以上述方式曲线绘制。

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5、双击坐标轴或者单击工具栏Format Axes图标进入坐标轴设置界面。将图形Shape改为Custom(自定义)的22cm×2cm,Frame style选择为No Frame、隐藏X和Y轴(Show Scale Bar也要取消勾选)。

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  • 将X轴范围最大值改为核苷酸刻度的最大值,这里是1453。

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6、删掉图标题和X、Y轴标题,使用文本框工具添加文本,适用箭头工具添加标记。

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  • 如果觉得默认配色不好看,可以自定义每一段的颜色


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