列线图(Alignment Diagram),又称诺莫图(Nomogram图),它是建立在多因素回归分析的基础上,这里的回归既包括Logistic回归也包括cox回归,通过回归分析将多个预测指标进行整合,然后采用带有刻度的线段,表达预测模型中各个变量之间的相互关系。
根据百度百科给的解释,其主要是通过模型中各个影响因素对结局变量的贡献程度,给每个影响因素的每个取值水平进行赋分,然后再将各个评分相加得到总评分,最后通过总评分与结局事件发生概率之间的函数转换关系,从而计算出该个体结局事件的预测值。
列线图既然也是一种图,那么它究竟代表的是什么呢?从本质上讲应该就是函数关系的可视化,将回归方程通过图形进行展示,使得结果更具有可读性。正是由于列线图这种直观便于理解的特点,使它在医学研究和临床实践中也逐渐得到了越来越多的关注和应用。
今天我们的主题便是如何借助R实现基于cox模型的列线图的绘制。
欲画该图,必备该包rms
这个example数据包含一个示例数据,如下,该数据集包括300个病人样本,6列数据,前两列是病人存活时间和存活状态,后面四列是年龄、性别、stage和血小板数四个指标,接下来的列线图模型主要是从四个因素进行列线图绘制:
4. 建立生存函数
7. 美化出图,如下: