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Nature撤回了张燕/张立新/刘平华等人的文章,主要原因是结论不可靠

自然界中含有过氧桥键的化合物具有多种生物活性,包括抗感染、抗肿瘤以及抗心律失常,其中最具代表性的青蒿素已经作为抗疟疾药物应用于临床接近40年。我国学者屠呦呦教授也因发现青蒿素(artemisinin)而共同获得2015年诺贝尔生理与医学奖。已分离出许多含过氧桥键的次级代谢物,并显示出对人体健康的有益作用。然而,大多数环内过氧化物生物合成的机制还没有被很好地理解。尽管在某些情况下已提出环内过氧化物是关键的反应中间体,但唯一特征明确的环内过氧化物生物合成酶是前列腺素H合酶,一种含血红素的酶。烟曲霉的Fumitremorgin B环内过氧化物酶(FtmOx1)是第一个报道的依赖α-酮戊二酸的单核非血红素铁酶,可催化环内过氧化物的形成反应。


2015年11月2日,德克萨斯大学奥斯汀分校张燕,波士顿大学刘平华,中国科学院微生物研究所张立新,共同通讯在Nature 在线发表题为“Endoperoxide formation by an α-ketoglutarate-dependent mononuclear non-haem iron enzyme”的研究论文,该研究报告了FtmOx1及其与共底物(α-酮戊二酸)或底物(fumitremorgin B)形成的二元配合物的X射线晶体结构。独特的是,在α-酮戊二酸酯以双齿形式结合到单核铁中心后,酪氨酸残基将剩余的氧结合和活化开放位点(Y224)与底物或溶剂隔离。用丙氨酸或苯丙氨酸替代Y224时,FtmOx1催化作用从过氧化物的形成转移到更常见的羟基化反应。该研究结果有助于阐明这种过氧化物形成反应的新机理。


但是,在2021年5月19日,该文章被撤稿,主要原因是结论不可靠。作者张燕同意本文的撤稿,而其他作者则坚持其数据,不同意本撤稿据了解,这是Nature 第二次撤回了有中国学者作为通讯单位的文章。另外,2020年7月22日,邢立达等人撤回了Nature 文章。


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Nature 杂志社撤回了该文章,因为经过与同行评审者的广泛磋商,已经注意到,其中包含的数据不支持其关于泛黄霉素B环内过氧化物酶(FtmOx1)的机制以及Tyr224在催化中的核心作用的主要结论

进一步的专家审查晶体结构4ZON的结果是,据称显示Fumitremorgin B与FtmOx1结合(原始文章的图2f),指出底物密度也可以分配给结合的MES缓冲液和水分子簇。Nature 杂志社已经通知蛋白质数据库有关条目4ZON的信息。因此,泛黄霉素B的催化活性结合模式仍然不确定。

关于Tyr224突变体的生化数据并不能最终支持将观察到的瞬态基团分配给Tyr224或它在催化中的作用。作者张燕同意本文的撤稿,而其他作者则坚持其数据,不同意本撤稿。


参考消息:
https://www.nature.com/articles/s41586-021-03527-x
https://www.nature.com/articles/nature15519




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