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Science | DNA复制时机决定致癌染色体易位发生

近期,Science杂志在线发表了奥地利分子病理学研究所(IMP)Rushad Pavri课题组题为DNA replication timing directly regulates the frequency of oncogenic chromosomal translocations的研究论文,该研究发现在B细胞的抗体成熟过程中,DNA复制时机(RT)直接调节淋巴瘤MYC-IGH基因易位的发生,染色质折叠造成MYC和IGH空间上邻近,从而产生了一个复制中心,MYC和IGH的复制起点被同步激活,促进该易位现象的发生RT形成了染色体易位过程中,DNA双链断裂DSB形成和DSB连接之间的基础。


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在B淋巴细胞中,通过突变和重新排列免疫球蛋白(Ig)基因使抗体库多样化。B细胞中表达了激活诱导的脱氨酶(AID),AID会导致DNA发生突变,修复AID诱导的错配过程中,在Ig基因上产生了DNA双链断裂,DNA双链断裂在免疫球蛋白基因多样化中起着关键作用。IGH高效的重组过程发生在S期,并且需要微染色体维持(MCM)解旋酶复合物(参与打开复制起点双链DNA打开)的参与。

AID也会使原癌基因发生突变,特别是MYC和BCL6,导致这些基因产生DNA双链断裂。原癌基因和IG基因间的DNA双链断裂连接后,发生了染色体易位,导致了原癌基因表达的失常和癌症的发生。

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Rushad Pavri课题组通过RNA干扰降低Mcm6的表达发现,MYC和IGH易位频率和两基因的复制起点活性均降低。此外,对MYC复制起点ORI的删除只降低MYC-IGH易位事件的发生,而不影响MYC的突变频率或转录。通过Cas9在MYC中引入DNA双链断裂,也不能恢复MYC基因ORI缺失突变体中的染色体易位频率。这些结果表明,在DNA双链断裂形成后,MYC的复制起点对于MYC-LGH染色体易位发生非常关键,并且与DNA双链断裂频率无关。

DNA复制起点活性影响复制时间(RT),进一步的RT分析发现,AID的靶基因通常是早期复制的。在MYC基因ORI缺失突变体中,MYC基因的RT发生了从早期到晚期转换,从而形成了一个以MYC为中心的晚期RT域。重新将ORI插入到ORI缺失的MYC突变体的下游,MYC又恢复成早期RT,并且MYC的易位也恢复到野生型的水平。

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通过分析野生型和突变体中MYC和IGH的基因组相互作用频率,研究发现在ORI缺失的MYC突变体和MCM敲低的细胞中,MYC和IGH基因组的相互作用频率下降,但在ORI缺失的MYC突变体中插入新的MYC复制起点时,MYC和IGH基因组的相互作用频率恢复,这表明RT的变化影响易位伴侣基因空间上的临近。研究者提出假设:IGH基因座与MYC基因座相互作用,通过液-液相分离形成一个枢纽,该中心将有利于MYC和IGH复制起始的同步,因此有利于易位所需的重组事件的同步。而其中潜在的机制仍然需要进一步的探索。

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最后Rushad Pavri课题组通过对人类细胞中与白血病相关的AFF4-MLL1和淋巴瘤相关的BCL6-IGH易位的研究提出,RT可能与易位导致的肿瘤发生有关。该研究提出了参与两种不同功能(例如激活DNA复制起点和DNA修复功能)的不同染色体的复制簇可以在一个共同的枢纽中相互作用的想法,而染色体间相互作用可能会导致遗传不稳定的异常重组,进一步导致肿瘤的发生。同期Science发表了专项评述:Replication timing and genetic instability。

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原文链接:
https://doi.org/10.1126/science.abj5502


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