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如何用GraphPad Prism 8 拟合模型

许多科学家对拟合曲线的使用比任何其他统计技术都要频繁。然而,很少有统计文本可真正解释曲线拟合的原理。但是,在GraphPad官方的Prism中文用户指南里,涵盖了拟合曲线的简要介绍,尤其是非线性回归。



Prism使得将模型拟合到数据非常容易,本篇的内容比较简单直接,手把手教大家如何使用非线性回归拟合模型——如何用Prism拟合模型。


步骤1:输入数据

创建一个XY工作台,并输入数据。如果在每个X值上均有重复的Y值,请格式化表格,输入重复值。
从XY表格或图中,点击快捷按钮,使用非线性回归拟合模型。或者点击“分析”并从“分析”对话框中选择。
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步骤2:选择一个模型

非线性回归使用模型拟合数据。因此,您必须选择一个模型或输入一个新模型。

步骤3:选择(或检查)初始值

非线性回归是一种迭代过程。程序必须从每个变量的估计值(处于正确“范围”内)开始,比如说在实际值的五倍以内。然后,会对这些初始值进行调整以提高拟合度。见非线性回归的工作原理。
如果您使用内置方程,则GraphPad Prism会自动提供初始值。如果输入自己的方程,也可输入初始值规则。例如,一项参数的初始值可以是数据中最大Y值的两倍,而另一项参数的初始值可等于最高和最低X值的平均值。在定义这些规则后,Prism将根据数据范围计算适当的初始值。
初始值“非线性回归”对话框的选项卡允许您检查和覆盖所计算的初始值。
如果您已查看数据图表、理解模型,并理解方程中所有参数的含义,就会发现很容易估算初始值。记住,只需要一个估算值。不一定要非常准确。如果在估计初始值时遇到问题,请先将数据放在一边,使用模型模拟曲线。每次更改一个变量,并查看其如何影响曲线的形状。在您了解参数如何影响曲线后,您可能会发现更容易估计初始值。
拟合一个简单的模型来清理数据时,如果初始值与正确值相差甚远,这并没有多大关系。无论使用什么初始值,您均会得到相同的最佳拟合曲线,除非初始值非常不正确。数据有很多分散或者模型有很多变量时,初始值更重要。


步骤4:决定是否约束任何参数

执行非线性回归时,不必拟合方程中的每项参数。取而代之的是,您可将一个或多项参数固定为常量。只有几个数据点时,定义常数通常很有帮助。例如,可将S形曲线或指数衰减的底部稳定段固定为零。
请记住,非线性回归程序没有“常识”。您需要考虑一下您是如何做实验的,并决定是否应固定一些参数。例如,如果已减去背景信号,则将剂量 - 反应曲线或指数衰减曲线的底部稳定段固定为零是有意义的。
Prism还允许将参数值约束在一定的范围内。


步骤5:如果同时拟合两个或多个数据集,请决定是否共享任何参数

如果将数据输入到两个或多个数据集列中,Prism将在一次分析中对全部列进行拟合。但除非指定共享一个或多项参数,否则每个拟合均将独立于其他拟合。共享参数时,分析称为 全局非线性回归。


步骤6:决定加权方案

非线性回归程序通常对每个点的权重相等。但有很多方法可 影响各点。


步骤7:选择其他选项

阅读关于范围、输出和“诊断”选项卡。




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