疾病相关数据库

IDDB：不育症在线数据

IDDB(http://mdl.shsmu.edu.cn/IDDB/)提供与不孕症有关的基因、实验和临床记录的多功能的数据库。里面的数据可以免费提供给对生殖和不孕症感兴趣的生物学家和医生。

StoneMod:肾结石相关数据库

StoneMod(https://www.stonemod.org)收集了肾结石相关的蛋白，通过这个数据库可以了解那些蛋白和肾结石相关。

MosaicBase: 非肿瘤疾病相关数据库

MosaicBase(http://mosaicbase.com/)是一个非肿瘤相关的数据库，通过疾病，突变或者基因的检索来发现输入内容和疾病的特征。

PCOSKB: 多囊卵巢数据库

PCOSKB(http://www.pcoskb.bicnirrh.res.in/)是一个检索和多囊卵巢有关基因的数据库。

CaNDis: 疾病药物检索数据库

CaNDis(http://candis.ijs.si/#)是一个检索疾病相关药物数据库。

DNA相关数据库

muTarget: 突变对于基因表达的影响

muTarget(http://www.mutarget.com)是一个对分析突变对于基因表达影响的数据库。

hTFtarget: 转录因子调控预测数据库

hTFtarget(http://bioinfo.life.hust.edu.cn/hTFtarget)是一个综合性的预测转录因子靶标的数据库。

RNA相关数据库

ncRDeep: 非编码RNA分类数据库

ncRDeep(http://home.jbnu.ac.kr/NSCL/ncRDeep.htm)是一个基于神经网络来预测non-coding RNA的数据库。

LncAS2Cancer：lncRNA可变剪切相关数据库

LncAS2Cancer(https://lncrna2as.cd120.com/)是一个预测在肿瘤发生过程中和肿瘤有关的数据库。

MNDR v3.0: ncRNA与疾病相关数据库

MNDR v3.0(http://www.rna-society.org/mndr/)是一个储存疾病相关ncRNA的数据库。MNDR v3.1当前包含超过一百万个ncRNA疾病条目，包括6,301多种miRNA，39,880多种lncRNA，20,256 circRNA，10,894 piRNA和521个snoRNA，它们具有1,600多种疾病，并且物种覆盖率增加到11种哺乳动物。

蛋白相互数据库

dbCAN-PUL: 碳水化合物活性酶数据库

dbCAN-PUL(http://bcb.unl.edu/dbCAN_PUL/)一个经过实验验证的碳水化合物活性酶及其底物数据库。

MPTherm-Pred: 跨膜蛋白突变预测数据库

MPTherm-Pred(https://web.iitm.ac.in/bioinfo2/mpthermpred/)是一个预测跨膜蛋白突变对于热稳定性的分析和预测数据库。

iDRBP_MMC: DNA结合蛋白以及RNA结合蛋白识别数据库

iDRBP_MMC(http://bliulab.net/iDRBP_MMC)是一个基于神经网络识别DNA结合蛋白以及RNA结合蛋白的数据库。

iDPPIV-SCM: 二肽基肽酶IV抑制肽数据库

iDPPIV-SCM(http://camt.pythonanywhere.com/iDPPIV-SCM)是一个基于序列预测二肽基肽酶IV抑制肽数据库

TBDB: T-box核糖体折叠注释数据库

TBDB(https://tbdb.io)是一个注释T-box核糖体的数据库。

DynaMut2: 错义突变对于蛋白稳定性和灵活性的影响

DynaMut2(http://biosig.unimelb.edu.au/dynamut2)是一个预测错义突变对于蛋白稳定性和灵活性的影响。

SAAMBE-SEQ:蛋白质复合物中的单个突变后的结合能变化预测数据库

SAAMBE-SEQ(http://compbio.clemson.edu/saambe_webserver/indexSEQ.php#started)是一个通过序列预测蛋白复合物当中单次突变对于结合能变化影响的数据库。

HybridSucc: 琥珀酰化位点预测数据库

HybridSucc(http://hybridsucc.biocuckoo.org/)是一个基于序列来预测琥珀酰化位点预测数据库。

CancerEnD: 肿瘤相关增强子数据库

CancerEnD(https://webs.iiitd.edu.in/raghava/cancerend/)是一个基于整合了多个数据库，来寻找和肿瘤相关增强子的特征的数据库。

流程化在线工具

PAWER：蛋白芯片分析网站

PAWER(https://biit.cs.ut.ee/pawer)是一个在线分析蛋白芯片的网站。通过分析可以获得差异蛋白的结果以及简单的富集分析的结果。

其他数据库

SMI-BLAST: 蛋白BLAST数据库

SMI-BLAST(http://bliulab.net/SMI-BLAST/)是一个蛋白blast的数据库。同时可以了解其蛋白的三级结构。

METAGENOTE: 基因组注释数据库

METAGENOTE(https://metagenote.niaid.nih.gov)是一个基因组注释和比对的数据库。