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CancerMiRNome:肿瘤相关miRNA综合性分析数据库

今天就给大家介绍一个对 肿瘤相关的 miRNA 表达谱分析的数据库 CancerMiRNome (http://bioinfo.jialab-ucr.org/CancerMIRNome/#tab-1929-4)

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背景数据集

在这个数据库当中,作者纳入了 TCGA 数据库当中的 miRNA测序的数据。同时由于 miRNA也是可以用于疾病的诊断的。所以作者就在其他的公共测序储存数据库当中寻找了以血清学为标本类型的 miRNA 测序数据。期望也可以寻找作为标志物的 miRNA。

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数据库使用

数据库方面的使用的话。就是选择想要分析的 miRNA 即可。

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结果呈现的话,包括了:TCGA 泛癌分析、靶基因预测、功能富集以及循环标志物分析

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另外对于血清 miRNA 表达数据。还可以进行类似 LASSO 的分析来进行诊断标志物选择。

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以上就是这个数据的主要功能了。同时这个数据库提供了数据下载的功能。但是需要注意的是,在这个数据库里面下载的数据是 R 语言特定的数据。只能通过 R 语言加载。


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