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重量级级miRNA数据库4miRs使用指南

几天有小伙伴问关于 miRNA 的数据库,由于 miRNA 相关的数据库太多了,要是分开介绍的话估计要好久好久。幸好,有人已经把 miRNA 相关的数据库整理好了,我们只需要基于自己的目的进行查找就可以找到相对应的数据库然后进行使用就行了。这个数据库就是4miRs https://tools4mirs.org/


数据库使用


对于数据库的使用,由于网站已经分好类了,我们就基于基于其中一个目的来查找即可,来进行搜索就可以得到相对应的数据库了。由于miRNA用到最多的是靶点预测,所以这里我们就选择miRNA相关的靶点预测看一下如果筛选数据库。我们在这里点击: "Target Prediction"。

点击之后我们就可以看到下面的这个界面,界面当中提供了,我们用来筛选数据库的条件。我们只需要基于自己的需求来选择即可。如果某一项不选的话,那就代表都全选。


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这里我们在物种里面选择: "human" + "online"。选完之后,我们点击"filter"就可以筛选了。筛选完的结果是以表格的形式来进行呈现的。我们需要做的就是,通过里面的描述来进行数据库筛选。


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数据库总结


这个数据库的使用基本上就是这样的,剩下的,就是我们基于出来的内容去选择自己想用的数据库了。对于数据库的选择建议还是:

  1. 选择发表日期近的数据库,这样的数据库至少里面包含的数据肯定会比之前发表的多。

  2. 选择被引次数多的数据库,这样被引的多说明相对来说比较权威。

这类总结其他数据库的网站,最怕的还是不更新了,这样的话,那我们也就检索不到最新的数据库了。但是这个数据库上面,写了最近的更新是最近,所以应该还是一个时常更新的数据库的。但是这个数据库可能只是纳入,对于其纳入的数据库是不是后来就关闭了,没有筛查,所以我们有一些可能点开发现数据库网址关闭了,例如:MAGI这个。就是这样的结果,这个也是没办法的,既然这样那就找下一个呗。


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