以人的K-RAS基因为例讲述一下找基因启动子序列的具体操作步骤:
1.打开NCBI的Map viewer页面,
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview/index.html
2.点击“GO”出现如下页面:
3.出现下图,RAS参考序列给出了两个,序列有微小的差异,但总体来说基本相同。现在普遍采用的是“reference”那个序列。
4.点击上述两条序列第一条序列(即12 reference)对应的“Genes seq”,出现新的页面,点击下图出现的“Download/ViewSequence/Evidence ”,即可下载查看序列等功能。
5.出现的页面提示K-ras基因在染色体上的位置:
6.因为启动子一般在-2000~+200区域,把页面中的参数修改一下:
7.那么就得到K-ras的启动子区域,如下图: