总的来说，上传数据分为三个步骤。如下：
①创建BioProject（用于描述项目的基本信息，里面可包含多个BioSample。BioProject 号以 PRJNA 开头，如 PRJNA*****）
②创建BioSample（主要是描述样本的基本属性，比如采样地点、采样时间、经纬度等。通常 BioSample 号以SAMN 开头，如 SAMN*****）
③上传数据
下面就是每步详细的sao操作
1 BioProject的创建
1.1 访问下面链接，New submission
https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs/bioproject/
1.2 填写Submitter
如实填写信息就行了
1.3 Project Type填写
一般高通量测序数据可选择“Raw sequence reads”
根据自己的样本，选择Sample scope（通常来说，Sample scope是对实验物种的简洁描述或者说是一个题目）
1.4 Target填写
给自己的项目取个名字
1.5 General Info信息填写
Release date:选择数据释放的时间
Project title :根据上一步的Target填写一个项目名称
下面就是否要选择关联其他数据，No就不用填写，Yes就必须要填写
1.6 Biosample
这一步可以直接Continue，等创建好了BioProject再创建BioSample
1.7 Publications
填写PubMed ID 或DOI 号
这一步可以直接Continue
注：BioSample 和Publications 这两步可以省略，后期发邮件给NCBI 进行修改。
1.8 确认无误后，点击“Submit”按钮，创建该Project。经过以上步骤，经过批准会发送到邮箱里面，获得以 PRJNA 开头的BioProject ID。
2 BioSample的创建
访问下面的链接，New submission
https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs/biosample/
2.1 Submitter的填写会自动填充
2.2 General Information
根据自己的需求选择释放样本的时间，这里选择的是立即释放。第二个是选择多样本还是单样本上传。
2.3 Sample Type
根据自己的项目进行选择，不过一般扩增子数据都选择Metagenome or environmental
2.4 Attributes
填写样本属性信息
可以选择上传excel表格，表格信息填写如下
每列信息说明：
sample_name：样品名；
sample_title：每个处理可以写一个题目，可选；
description：处理的描述，可选；
organism：优势物种名，如：metagenome
collection_date：采样时间，如：2014-08-15和15-Aug-2014；
geo_loc_name：采样地，如：China:Beijing；
lat_lon：经纬度，如：39 N 116 E；
isolation_source：分离环境，如：Rhizosphere soil；
注：表格中的绿色是必填项，一定要保证至少有一列可以区分各个样本（名字除外）
表格提交后，一定要保证没有任何warnings，不然即使提交上去也不会通过，如果爆出“Warn”信息，则需要等待2 个工作日方能重新进行该步骤。
2.5 确认无误后，点击最后的“Submit”按钮。经过以上步骤，邮箱会收到以 SAMN 开头的BioSample ID。
3 上传SRA数据
访问下列链接
https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs/sra/
3.1 Submitter自动填充
3.2 General Information填写
BioProject：填写已经创建好的BioProject号
BioSample：选择已经创建了BioSample
Release date: 选择释放数据的时间
3.3 SRA metadata信息上传
选择以excel的形式上传，表格内容如下：
这里要根据自己的实际情况进行填写。
3.4 原始数据上传
这里有FTP和Aspera Command-Line上传，在这里选择Aspera Command-Line上传（一是快，二是逼格高）
上传代码：
ascp -i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh -QT -l100m -k1 -d ~/xx/16S/*.fastq subasp@upload.ncbi.nlm.nih.gov:uploads/xxxx_IAinE4W6/JSS_16S/
上传后选择select preload folder进入文件，刷新数据，需要点时间，文件也会慢慢的刷新出来：
3.5 提交
3.6 等待验证通过
测序数据上传完成。NCBI会在后台审核数据，最后给出Accession Number，一般一天左右。
到此，整个数据的上传都已完成。
此文同步更新到github：https://github.com/songzhang-master/SRA_submit
