既然衰老研究这么火热，那肯定是有专门的数据库。今天跟大家分享一个最新的衰老相关单细胞数据库：AgeAnno。

数据库地址：

https://relab.xidian.edu.cn/AgeAnno/#/

AgeAnno是第一个通过分析scRNA和scATAC数据系统地描述人类不同组织和细胞类型中与衰老相关基因的数据库。该数据库在2023年1月发表于Nucleic Acids Research，文章标题：AgeAnno: a knowledgebase of single-cell annotation of aging in human.

目前AgeAnno数据库整合了来自28种健康组织样本的1 678 610个细胞。共收录了276个样本，年龄从0岁到110岁不等。将所有样本分为四个年龄段：0至19岁(Youth group)；20至59(Mid group)；60至100岁(Old group)和>100岁(Supold group)。此外作者从以前的研究中收集了5580个与衰老相关的基因。

对于scRNA数据，该数据库可以进行差异基因分析、基因变异系数、细胞通讯网络、转录因子(TF)调控网络和免疫细胞比例等分析。AgeAnno还为scATAC数据提供差异染色质可及性分析、Motif/Tf富集和足迹分析以及共可及性分析。此外还提供了衰老相关的疾病和药物/化学-基因相互作用信息。

（1）Cell map module

该模块提供了不同年龄组的细胞数量和细胞特异性标记基因，可以选择感兴趣的组织类型，并查看细胞比例、标记基因和细胞簇的全局图。

（2）Aging-related DEG module

该模块比较衰老相关基因在不同年龄组中的表达，还提供了关注基因是特定于组织还是特定于细胞类型的信息。

（3）Aging-related variation coefficient module

该模块对每种细胞类型中与衰老相关的基因进行了变异系数分析，可以搜索到关注基因的信息和单个细胞类型的变异系数雷达曲线图。

（4）Aging-related pathway module

该模块将帮助用户识别与衰老相关的基因的潜在生物学功能和途径，可以按感兴趣的年龄组、组织类型或细胞类型进行搜索。

（5）Cell–cell communication module

该模块通过不同细胞类型的配体受体对（L-R）进行了细胞-细胞通讯网络分析，可以获得对识别出的不同年龄段的衰老相关的L-R对的分析结果。

（6）TF regulatory network module

该模块用于识别跨细胞类型的TF靶基因调控网络。在TF调节网络模块中，可以获得调控年龄依赖性表达变化的潜在TF调节因子。

（7）Immune cell proportion module

该模块可以获得不同年龄段的免疫细胞比例，用于探索衰老对免疫微环境的影响。

（8）Aging-related DAR module

该模块提供了与衰老相关的差异可及性区域（DAR）来检测染色质可及性的变化，以探索与衰老相关基因潜在表观遗传机制。

（9）Co-accessibility link module

该模块提供衰老相关DAR的共可及性分析，以探究基因组元件(如启动子-增强子）之间的相互作用。

（10）Motif/TF enrichment module

该模块基于衰老相关的DARs进行基序/TF富集分析，还评估了不同年龄组的TF结合活性。

（11）Related human diseases and chemical/drug module

该模块提供了衰老相关疾病信息（来自DisGeNet数据库），还提供从CTD提取的基因-化学/药物相互作用，用户可以通过基因符号和药物名称进行搜索，以获得基因与药物的相互作用和药物的详细信息。

（12）Links module curated aging-related tools and methods

用户可以在“Links ”模块中获取已发布的与衰老相关的工具和算法。

“Home”页面上的“Quick Search”允许用户通过两种途径进行数据查询，包括“search by tissue”(选择感兴趣的组织)和“search by gene”(输入基因符号或基因EntrezID)。用户可以在“Links”功能中获取已发布的与衰老相关的工具和算法。AgeAnno还提供结果下载、统计和帮助功能。