科研星球

值得你收藏的科研实验数据整理技巧

读研究生的同学,无论是硕士生还是博士生,都离不开科研实验。


我们通过千辛万苦,得到了数据,这时候可不要以为万事大吉了,重头戏在后面呢——整理实验数据。

今天,笔者就来分享一下自己整理数据的一点经验吧~


一、「完整全面」地记录数据

实验数据必须完整全面地记录,实验时间、实验步骤、实验结果缺一不可。

好记性不如烂笔头。不要对自己的记忆过度自信,觉得记在心里就好了,等到准备写论文的时候面对一堆数据一脸茫然,这是什么,这又是什么...

「实验时间」一定要写

实验往往不是一次就可以都得到理想的结果,很可能需要重复,重复,再重复,这时候日期就非常重要了。

遥想当年,笔者刚开始做实验的时候,有一个实验重复了 5、6 次,原始数据是 Excle 。当时,笔者对自己的记忆过分自信,觉得心里记住了就可以了,所以没有记录日期。

结果几个月后想要写论文的时候,发现记忆早已经模糊,根本不记得哪个数据是自己所需要的,所以只能哭着把数据又全部分析了一遍……

实验步骤一定要写

作为实验狗,笔者做实验前,尤其是新实验(哪怕是实验室师兄师姐已经做了 N 遍的实验)先尽可能的写清楚实验步骤(Protocol)。能写多细写多细,细到别人照着可以完全复现整个实验流程和结果。

这么做,一是规范实验操作,二是利于 Review,寻找问题所在。

个人习惯记录以下几个部分:

1)实验日期。

2)耗材准备,包括试剂、器械。实验前 check 下,确保准备充分,不至于实验过程中手忙脚乱。

3)具体实验步骤,千万不要怕麻烦。一定要尽可能的详细,细致到实验的小细节。

4)检测仪器,包括型号及检测时所使用的具体参数。这么做有两方面的原因,一是方便写文章,二是为了统一参数,实现实验的标准化。

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图片来源:自己做的


「实验结果」一定要如实记录

要精确地记录你的实验结果,包括不理想的实验数据。千万不要有侥幸心理,只留理想的数据,把不理想的数据删掉。

如果和预测的结果不同,要分析问题的可能原因,是设计的问题?还是操作的失误?

在进行重复实验的时候,不要删除旧数据。也许兜兜转转后,发现它才是对的……


二、「不厌其烦」地整理数据 

实验数据有多重要,笔者就不多说了。

研二的时候,同院的一个博士师姐的电脑在图书馆被偷了,实验数据没有备份,笔者至今还记得她在朋友圈里的绝望。

从此,笔者的数据都是电脑一份,硬盘一份,云盘一份,感觉十分安全呢~

咳咳,切入正题,根据时间远近,可以把数据分为需要短期处理的数据及需要长期保存的数据。

首先,是短期需处理的数据。一旦得到新的实验结果,要尽快整理成图表。

我们得到的数据也许是数字,也许是图片。我们不可能凭肉眼主观判断这些数据是否符合我们的期望,只有通过图表才能观察到问题所在。

关于分析数据、作图,个人比较喜欢用 Photoshop 整理各种图片,用 GraphPad Prism 作图,然后用 AI 将它们组合起来。

今天聊一聊 GraphPad Prism,普通的统计方法,比如方差、ROC 曲线、t 检验都能满足,而且作图功能也很强大。有了它的帮助,漂亮的图将不再遥远。

分享几个作图小 Tips:

绘制图表,从审美开始。

在作图之前,我们不妨参考 CNS 文章的图片,找到对应的数据图,看看别人是怎样的风格样式。

一开始新建文件的时候,如果你不确定自己的数据适合哪种图,可以点开示例,看一看哪种图适合,也可以克隆已有的文件,如下图。

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图片来源:GraphPad Prism 软件截图


一个 Prism 文件不局限于一个图表,最多可以创建几百个数据表、图形文件,一个课题一个文件足够了。

制作好的图表可以用 Powerpoint 做成 PPT 格式。最好严格按照论文发表格式来制作,哪怕是阴性结果,这样以后无论是 Seminar 做汇报,还是撰写文章都会方便很多,省时又省力。

接着是数据的长期保存,一定要备份!备份!备份!重要的事情说 3 遍。

笔者习惯用以下 3 种形式保存实验数据:

1)纸质笔记本

准备一本专业的实验记录本,最好有连续的页码。笔者的习惯是一个课题准备一个单独的实验记录本,里面记着实验条件及日期,平时做实验时随身携带。

2)Excel 表格

这个包括原始的数据及整理后的数据,这个会记录实验的所有内容。

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图片来源:自己做的


3)PPT 演示文稿

制作好的图表笔者会统一放在 PPT 中,和实验记录本一样,一个课题有一个单独的 PPT。这样组会汇报的时候可以直接拿来用,不用临时整理制作 PPT 了。

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图片来源:自己做的


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图片来源:自己做的


实验数据的整理作为科研过程中必不可少的一部分,会直接影响到论文的结果。同时,这些数据要经得起其他人推敲及反复试验,更是不容小觑。

希望今天的分享会对大家的科研有所帮助。


文章作者:如初,来自科研论文时间

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